Bandara Komodo menyediakan Ruang VIP dan VVIP yang dirancang untuk memberikan kenyamanan, privasi, dan pelayanan eksklusif bagi tamu penting, pejabat, serta pengguna jasa tertentu. Interior ruangan dihiasi dengan kain tenun adat khas Nusa Tenggara Timur, menghadirkan nuansa budaya lokal yang elegan sekaligus memperkenalkan kekayaan tradisi daerah kepada para tamu. Ruangan ini dilengkapi dengan area duduk yang nyaman, fasilitas pendukung yang representatif, serta mushola untuk memenuhi kebutuhan ibadah pengguna jasa. Kehadiran Ruang VIP dan VVIP ini mencerminkan komitmen Bandara Komodo dalam menyediakan layanan premium yang mengedepankan kenyamanan, keramahan, dan sentuhan budaya lokal sebagai identitas khas gerbang udara Labuan Bajo.