Gedung Terminal Penumpang Bandara Komodo dirancang dengan arsitektur ikonik yang terinspirasi dari bentuk hewan komodo, satwa endemik khas Nusa Tenggara Timur yang menjadi identitas kuat Labuan Bajo. Desain ini merepresentasikan karakter komodo yang tangguh, unik, dan mendunia, sekaligus menghadirkan citra terminal yang modern dan berkelas. Dengan luas bangunan mencapai 13.366 meter persegi, terminal ini dilengkapi berbagai fasilitas untuk menunjang kenyamanan penumpang, mulai dari area check-in, ruang tunggu, ruang VIP, fasilitas komersial, hingga layanan pendukung lainnya. Kehadiran terminal ini tidak hanya meningkatkan kapasitas pelayanan, tetapi juga menjadi simbol kebanggaan daerah serta pintu gerbang utama menuju destinasi pariwisata super prioritas Labuan Bajo dan Taman Nasional Komodo.